Genomic susceptibility to gastric cancer in Northwest Iran: population-based and case–control studies

Aghghaleh, Homa Akhavan; Ranji, Najmeh; Habibollahi, Hadi

doi:10.1186/s43042-024-00474-w

Egyptian Journal of Medical Human Genetics

Table 1 Statistical association between the variant frequencies in Ardabil population comparing Iran, Europe, and World data, based on their reported Age-Standardized Rates (ASR for Ardabil: 39.1, Iran: 16.6, Europe: 13.7, and World: 11.1)

From: Genomic susceptibility to gastric cancer in Northwest Iran: population-based and case–control studies

Variant	Ardabil*	Iran	Europe	World	Pearson Cor.**	P Value₁	Pearson Cor.***	P Value₂
rs10061133	0.13	0.127	0.097	0.091	0.741	0.259	0.998	0.038
rs10069690	0.127	0.13	0.27	0.26	− 0.716	0.284	− 0.987	0.101
rs1044165	0.077	0.07	0.14	0.13	− 0.637	0.363	− 0.970	0.156
rs1047768	0.46	0.52	0.59	0.57	− 0.912	0.088	− 0.974	0.145
rs1050631	0.27	0.33	0.36	0.35	− 0.973	0.027	− 0.983	0.118
rs10509577	0.01	0.01	0.07	0.06	− 0.693	0.307	− 0.968	0.161
rs1051740	0.29	0.24	0.3	0.3	0.020	0.980	− 0.996	0.054
rs10519613	0.163	0.14	0.1	0.11	0.878	0.122	0.970	0.156
rs1052133	0.3	0.31	0.22	0.22	0.633	0.367	0.996	0.054
rs1052536	0.35	0.35	0.46	0.41	− 0.639	0.307	− 0.931	0.238
rs1052555	0.36	0.36	0.33	0.31	0.638	0.362	0.875	0.322
rs1059394	0.49	0.48	0.31	0.34	0.722	0.278	0.968	0.161
rs1061302	0.37	0.4	0.31	0.31	0.473	0.527	0.996	0.054
rs11134527	0.25	0.36	0.26	0.25	− 0.209	0.791	− 0.581	0.605
rs11170877	0.08	0.08	0.1	0.11	− 0.658	0.342	− 0.909	0.274
rs1143633	0.28	0.26	0.35	0.35	− 0.559	0.441	− 0.996	0.054
rs11797	0.33	0.38	0.55	0.58	− 0.803	0.197	− 0.979	0.132
rs12220909	0.003	0.01	0.0009	0.0007	0.057	0.943	1.0	0.004
rs1229984	0.75	0.81	0.96	0.94	− 0.848	0.152	− 0.983	0.117
rs12691693	0.64	0.54	0.61	0.59	0.561	0.439	0.875	0.322
rs12983273	0.107	0.136	0.138	0.136	− 0.983	0.017	− 0.990	0.090
rs12983508	0.1	0.11	0.17	0.17	− 0.768	0.232	− 0.996	0.054
rs138978736	0	0.0012	0.00075	0.00064	− 0.756	0.26	− 0.999	0.148
rs1562313	0.18	0.21	0.2	0.2	− 0.855	0.145	− 0.996	0.054
rs1695	0.297	0.319	0.326	0.327	− 0.994	0.006	− 0.998	0.035
rs16999593	0.013	0.007	0.0003	0.002	0.918	0.082	0.978	0.132
rs17276588	0.047	0.03	0.029	0.041	0.665	0.335	0.689	0.516
rs1799950	0.1	0.05	0.07	0.065	0.816	0.184	0.974	0.146
rs1800469	0.52	0.58	0.68	0.67	− 0.882	0.118	− 0.990	0.089
rs1800668	0.37	0.33	0.31	0.28	0.868	0.132	0.909	0.274
rs1801394	0.4	0.45	0.55	0.52	− 0.858	0.142	− 0.959	0.183
rs1870134	0.02	0.0187	0.00369	0.00496	0.746	0.255	0.999	0.106
rs1884444	0.497	0.54	0.53	0.53	− 0.914	0.086	− 0.996	0.054
rs2010963	0.58	0.63	0.68	0.68	− 0.933	0.067	− 0.996	0.054
rs2066702	0	0.004	0.002	0.01	− 0.715	0.285	− 0.725	0.484
rs2066981	0.41	0.42	0.48	0.47	− 0.771	0.229	− 0.974	0.146
rs2069763	0.22	0.23	0.33	0.32	− 0.750	0.250	− 0.984	0.114
rs2070600	0.007	0.02	0.04	0.04	− 0.890	0.110	− 0.996	0.054
rs2074570	0.01	0.05	0.04	0.056	− 0.888	0.112	− 0.902	0.284
rs2075570	0.38	0.43	0.5	0.51	− 0.894	0.106	− 0.986	0.106
rs217727	0.13	0.13	0.19	0.19	− 0.694	0.306	− 0.996	0.054
rs2228570	0.74	0.75	0.61	0.61	0.656	0.344	0.996	0.054
rs2257082	0.19	0.22	0.27	0.27	− 0.882	0.118	− 0.996	0.054
rs2274084	0.027	0.02	0.002	0.01	0.806	0.194	0.915	0.264
rs2274223	0.42	0.36	0.32	0.32	0.964	0.036	0.996	0.054
rs2274976	0.047	0.037	0.044	0.046	0.341	0.659	0.689	0.516
rs2292832	0.51	0.64	0.7	0.7	− 0.983	0.017	− 0.996	0.054
rs2294008	0.4	0.41	0.45	0.45	− 0.964	0.323	− 0.996	0.254
rs2296147	0.34	0.41	0.48	0.45	− 0.916	0.084	− 0.959	0.184
rs2305158	0.2	0.23	0.23	0.22	− 0.866	0.134	− 0.866	0.134
rs2505901	0.32	0.45	0.5	0.49	− 0.986	0.014	− 0.991	0.085
rs2839698	0.39	0.45	0.51	0.45	− 0.803	0.197	− 0.814	0.395
rs2920297	0.35	0.37	0.46	0.45	− 0.796	0.204	− 0.984	0.114
rs2976391	0.57	0.51	0.46	0.45	0.944	0.056	1	0.006
rs2976394	0.37	0.41	0.46	0.46	− 0.912	0.088	− 0.996	0.054
rs3171425	0.5	0.55	0.59	0.57	− 0.931	0.069	− 0.956	0.189
rs33927012	0.05	0.02	0.01	0.01	0.992	0.008	0.996	0.054
rs3660	0.29	0.37	0.52	0.51	− 0.869	0.131	− 0.992	0.078
rs3730089	0.12	0.13	0.16	0.17	− 0.793	0.207	− 0.959	0.183
rs3732183	0.21	0.23	0.27	0.3	− 0.832	0.168	− 0.972	0.151
rs3738590	0.24	0.24	0.26	0.26	− 0.694	0.306	− 0.996	0.054
rs3741216	0.02	0.04	0.03	0.04	− 0.849	0.151	− 0.910	0.272
rs3741219	0.37	0.46	0.5	0.45	− 0.886	0.114	− 0.883	0.311
rs3744037	0.2	0.166	0.163	0.167	0.976	0.024	0.983	0.116
rs3745469	0.24	0.17	0.1	0.09	0.930	0.070	1.0	0.016
rs3762272	0.08	0.06	0.02	0.03	0.891	0.137	0.998	0.161
rs3764880	0.43	0.34	0.26	0.29	0.932	0.068	0.969	0.159
rs3765524	0.41	0.35	0.29	0.3	0.932	0.068	0.987	0.101
rs3804100	0.14	0.14	0.07	0.07	0.694	0.306	0.996	0.054
rs3810366	0.54	0.52	0.3	0.3	0.737	0.263	0.996	0.054
rs3825569	0.65	0.55	0.63	0.62	0.427	0.573	0.972	0.151
rs4072037	0.42	0.45	0.52	0.54	− 0.823	0.177	− 0.968	0.161
rs4652	0.39	0.4	0.42	0.43	− 0.837	0.163	− 0.987	0.101
rs4754	0.37	0.35	0.27	0.28	0.793	0.207	0.985	0.111
rs4711690	0.23	0.23	0.17	0.19	0.658	0.342	0.909	0.274
rs4789936	0.54	0.51	0.51	0.5	0.988	0.012	0.987	0.101
rs4796030	0.5	0.52	0.56	0.56	0.987	0.101	− 0.996	0.054
rs4880	0.45	0.47	0.5	0.49	− 0.887	0.113	− 0.959	0.183
rs4919510	0.17	0.22	0.19	0.2	− 0.702	0.298	− 0.972	0.151
rs4986790	0.03	0.06	0.06	0.06	− 0.985	0.015	− 0.996	0.054
rs4986791	0.03	0.06	0.06	0.06	− 0.985	0.015	− 0.996	0.054
rs5744168	0.03	0.05	0.06	0.05	− 0.915	0.085	− 0.914	0.266
rs6194	0.003	0.001	0.0001	0.0005	0.972	0.028	0.978	0.135
rs63750447	0.007	0.0006	0	0.0002	0.991	0.009	0.994	0.070
rs6413413	0.0067	0.004	0.006	0.005	0.567	0.433	0.751	0.460
rs6493	0.19	0.18	0.17	0.17	0.933	0.067	0.996	0.054
rs6494	0.2	0.21	0.22	0.2	− 0.430	0.570	− 0.414	0.728
rs6505162	0.58	0.56	0.46	0.45	0.780	0.220	1.0	0.010
rs6513497	0.1	0.11	0.07	0.06	0.565	0.435	0.987	0.101
rs698	0.24	0.24	0.39	0.37	− 0.698	0.302	− 0.976	0.140
rs699517	0.48	0.49	0.31	0.34	0.686	0.339	0.998	0.167
rs709816	0.36	0.47	0.35	0.4	− 0.309	0.691	− 0.417	0.726
rs7165402	0.12	0.16	0.13	0.14	− 0.569	0.431	− 0.910	0.272
rs731236	0.34	0.35	0.4	0.39	− 0.807	0.193	− 0.968	0.161
rs762551	0.59	0.6	0.7	0.69	− 0.750	0.250	− 0.984	0.114
rs763780	0.04	0.06	0.05	0.05	− 0.715	0.285	− 0.996	0.054
rs8113645	0.61	0.68	0.64	0.68	− 0.812	0.188	− 0.873	0.324
rs8177812	0.22	0.17	0.13	0.14	0.948	0.052	0.983	0.118
rs897986	0.69	0.68	0.64	0.61	0.711	0.289	0.888	0.304
rs910924	0.13	0.17	0.27	0.25	− 0.867	0.156	− 0.999	0.146
rs937283	0.25	0.27	0.41	0.38	− 0.743	0.257	− 0.966	0.166

Bold values indicate a statistically significant difference in allele frequency between Ardabil and other populations
^* Our results
^**Comparing our results with Iran, Europe, and World
^*** Comparing our results with Europe and World

Back to article page