Identification of the most potent acetylcholinesterase inhibitors from plants for possible treatment of Alzheimer’s disease: a computational approach

Sarkar, Bishajit; Alam, Sayka; Rajib, Tiluttoma Khan; Islam, Syed Sajidul; Araf, Yusha; Ullah, Md. Asad

doi:10.1186/s43042-020-00127-8

Egyptian Journal of Medical Human Genetics

Table 3 The results of the SP and XP docking study of the selected ligands along with their respective glide energies

From: Identification of the most potent acetylcholinesterase inhibitors from plants for possible treatment of Alzheimer’s disease: a computational approach

No	Name of the compound	Standard Precision (SP) Docking score/ Binding energy (Kcal/mol)	Extra Precision (XP) Docking score/ Binding energy (Kcal/mol)	Glide energy (Kcal/mol)
01	Coptisine	− 11.12	− 15.98	− 48.31
02	Myricetin	− 10.37	− 12.43	− 42.546
03	Quercetin	− 9.82	− 11.22	− 44.872
04	Isorhamnetin	− 9.66	− 10.31	− 47.76
05	Apigenin	− 9.51	− 9.96	− 44.67
06	Naringenin	− 9.36	− 10.22	− 53.39
07	Bellidifolin	− 8.96	− 9.79	− 49.191
08	Harmine	− 8.73	− 8.97	− 49.149
09	Imperatorin	− 8.49	− 8.81	− 42.072
10	Harmaline	− 8.34	− 9.07	− 38.62
11	Scoulerine	− 8.33	− 8.14	− 41.25
12	Marmesin	− 8.10	− 7.73	− 23.41
13	Isoimperatorin	− 8.06	− 7.46	− 33.972
14	Liriodenine	− 8.01	− 7.31	− 45.69
15	Carvacrol	− 7.99	− 7.19	− 27.98
16	Xanthotoxin	− 7.84	− 7.78	− 39.22
17	Corynoline	− 7.69	− 7.11	− 39.95
18	Ostruthin	− 7.59	− 6.90	− 48.51
19	β-amyrone	− 7.41	− 7.63	− 40.65
20	Lauro-tetanine	− 7.31	− 6.33	− 31.50
21	Ostruthol	− 7.28	− 9.52	− 42.707
22	Sidol	− 7.23	− 6.65	− 36.53
23	Berberine	− 7.13	− 6.63	− 47.86
24	Buxaminol A	− 6.84	− 7.44	− 24.70
25	Stylopine	− 6.74	− 6.12	− 32.544
26	Ochrobirine	− 6.74	− 7.87	− 28.776
27	Secoboldine	− 6.71	− 8.48	− 33.87
28	Skimmianine	− 6.62	− 6.13	− 40.65
29	Palmatine	− 6.45	− 6.90	− 30.91
30	α-pinene	− 6.33	− 8.09	− 30.32
31	Sudachitin	− 6.31	− 8.26	− 21.28
32	Eugenol	− 6.30	− 6.42	− 24.55
33	Kaempferol	− 6.27	− 9.25	− 31.34
34	Myrtenal	− 6.15	− 7.95	− 43.53
35	Cyclonataminol	− 6.11	− 5.41	− 33.46
36	Rupicoline	− 5.99	− 7.03	− 48.430
37	α-terpineol	− 5.84	− 6.32	− 36.76
38	Estragole	− 5.77	− 6.24	− 44.384
39	Luteolin	− 5.74	− 6.87	− 28.76
40	Geraniol	− 5.69	− 7.19	− 34.712
41	1,8-cineole	− 5.67	− 4.05	− 44.68
42	Asimilobine	− 5.66	− 7.05	− 22.69
43	Rutin	− 5.64	− 7.30	− 43.66
44	Sideridiol	− 5.54	− 8.94	− 28.92
45	Ursolic acid	− 5.40	− 6.95	− 34.12
46	Linearol	− 5.24	− 6.56	− 36.59
47	Chelidonine	− 5.15	− 5.89	− 40.963
48	Verbenone	− 4.80	− 4.17	− 27.52
49	Mangiferin	− 4.65	− 4.22	− 29.058
50	Allocryptopine	− 4.39	− 2.66	− 32.638
Positive control 1	Donepezil	− 7.34	− 9.10	− 43.91
Positive Control 2	Galantamine	− 6.15	− 8.21	− 41.29

Back to article page