Skip to main content

Table 3 The results of the SP and XP docking study of the selected ligands along with their respective glide energies

From: Identification of the most potent acetylcholinesterase inhibitors from plants for possible treatment of Alzheimer’s disease: a computational approach

No Name of the compound Standard Precision (SP) Docking score/ Binding energy (Kcal/mol) Extra Precision (XP) Docking score/ Binding energy (Kcal/mol) Glide energy (Kcal/mol)
01 Coptisine − 11.12 − 15.98 − 48.31
02 Myricetin − 10.37 − 12.43 − 42.546
03 Quercetin − 9.82 − 11.22 − 44.872
04 Isorhamnetin − 9.66 − 10.31 − 47.76
05 Apigenin − 9.51 − 9.96 − 44.67
06 Naringenin − 9.36 − 10.22 − 53.39
07 Bellidifolin − 8.96 − 9.79 − 49.191
08 Harmine − 8.73 − 8.97 − 49.149
09 Imperatorin − 8.49 − 8.81 − 42.072
10 Harmaline − 8.34 − 9.07 − 38.62
11 Scoulerine − 8.33 − 8.14 − 41.25
12 Marmesin − 8.10 − 7.73 − 23.41
13 Isoimperatorin − 8.06 − 7.46 − 33.972
14 Liriodenine − 8.01 − 7.31 − 45.69
15 Carvacrol − 7.99 − 7.19 − 27.98
16 Xanthotoxin − 7.84 − 7.78 − 39.22
17 Corynoline − 7.69 − 7.11 − 39.95
18 Ostruthin − 7.59 − 6.90 − 48.51
19 β-amyrone − 7.41 − 7.63 − 40.65
20 Lauro-tetanine − 7.31 − 6.33 − 31.50
21 Ostruthol − 7.28 − 9.52 − 42.707
22 Sidol − 7.23 − 6.65 − 36.53
23 Berberine − 7.13 − 6.63 − 47.86
24 Buxaminol A − 6.84 − 7.44 − 24.70
25 Stylopine − 6.74 − 6.12 − 32.544
26 Ochrobirine − 6.74 − 7.87 − 28.776
27 Secoboldine − 6.71 − 8.48 − 33.87
28 Skimmianine − 6.62 − 6.13 − 40.65
29 Palmatine − 6.45 − 6.90 − 30.91
30 α-pinene − 6.33 − 8.09 − 30.32
31 Sudachitin − 6.31 − 8.26 − 21.28
32 Eugenol − 6.30 − 6.42 − 24.55
33 Kaempferol − 6.27 − 9.25 − 31.34
34 Myrtenal − 6.15 − 7.95 − 43.53
35 Cyclonataminol − 6.11 − 5.41 − 33.46
36 Rupicoline − 5.99 − 7.03 − 48.430
37 α-terpineol − 5.84 − 6.32 − 36.76
38 Estragole − 5.77 − 6.24 − 44.384
39 Luteolin − 5.74 − 6.87 − 28.76
40 Geraniol − 5.69 − 7.19 − 34.712
41 1,8-cineole − 5.67 − 4.05 − 44.68
42 Asimilobine − 5.66 − 7.05 − 22.69
43 Rutin − 5.64 − 7.30 − 43.66
44 Sideridiol − 5.54 − 8.94 − 28.92
45 Ursolic acid − 5.40 − 6.95 − 34.12
46 Linearol − 5.24 − 6.56 − 36.59
47 Chelidonine − 5.15 − 5.89 − 40.963
48 Verbenone − 4.80 − 4.17 − 27.52
49 Mangiferin − 4.65 − 4.22 − 29.058
50 Allocryptopine − 4.39 − 2.66 − 32.638
Positive control 1 Donepezil − 7.34 − 9.10 − 43.91
Positive Control 2 Galantamine − 6.15 − 8.21 − 41.29